Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM74A1Q5RGS3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM74A1Q5RGS3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM74A1Q5RGS3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM74A1Q5RGS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM74A1Q5RGS3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms