Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf116Q5BN46 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf116Q5BN46 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf116Q5BN46 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms