Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM41BQ5BJD5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM41BQ5BJD5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM41BQ5BJD5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM41BQ5BJD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM41BQ5BJD5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms