Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC6Q16204 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC6Q16204 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC6Q16204 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC6Q16204 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC6Q16204 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC6Q16204 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC6Q16204 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC6Q16204 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC6Q16204 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC6Q16204 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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