Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD8Q15843 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD8Q15843 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD8Q15843 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD8Q15843 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD8Q15843 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD8Q15843 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD8Q15843 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD8Q15843 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD8Q15843 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8Q15843 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEDD8Q15843 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD8Q15843 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD8Q15843 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
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