Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIP10Q15642 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP10Q15642 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP10Q15642 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIP10Q15642 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP10Q15642 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIP10Q15642 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP10Q15642 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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