Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
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