Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CHAF1AQ13111 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CHAF1AQ13111 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CHAF1AQ13111 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CHAF1AQ13111 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CHAF1AQ13111 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CHAF1AQ13111 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
CHAF1AQ13111 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHAF1AQ13111 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CHAF1AQ13111 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHAF1AQ13111 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CHAF1AQ13111 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CHAF1AQ13111 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CHAF1AQ13111 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CHAF1AQ13111 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CHAF1AQ13111 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CHAF1AQ13111 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CHAF1AQ13111 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CHAF1AQ13111 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CHAF1AQ13111 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CHAF1AQ13111 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CHAF1AQ13111 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CHAF1AQ13111 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHAF1AQ13111 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHAF1AQ13111 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CHAF1AQ13111 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CHAF1AQ13111 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHAF1AQ13111 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHAF1AQ13111 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHAF1AQ13111 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHAF1AQ13111 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHAF1AQ13111 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHAF1AQ13111 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHAF1AQ13111 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHAF1AQ13111 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CHAF1AQ13111 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHAF1AQ13111 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHAF1AQ13111 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHAF1AQ13111 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CHAF1AQ13111 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHAF1AQ13111 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHAF1AQ13111 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHAF1AQ13111 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CHAF1AQ13111 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CHAF1AQ13111 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHAF1AQ13111 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CHAF1AQ13111 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CHAF1AQ13111 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHAF1AQ13111 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHAF1AQ13111 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHAF1AQ13111 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHAF1AQ13111 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHAF1AQ13111 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHAF1AQ13111 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHAF1AQ13111 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHAF1AQ13111 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CHAF1AQ13111 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CHAF1AQ13111 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHAF1AQ13111 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHAF1AQ13111 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHAF1AQ13111 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHAF1AQ13111 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHAF1AQ13111 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHAF1AQ13111 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CHAF1AQ13111 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHAF1AQ13111 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHAF1AQ13111 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHAF1AQ13111 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHAF1AQ13111 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CHAF1AQ13111 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHAF1AQ13111 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHAF1AQ13111 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHAF1AQ13111 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHAF1AQ13111 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHAF1AQ13111 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHAF1AQ13111 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHAF1AQ13111 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHAF1AQ13111 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHAF1AQ13111 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHAF1AQ13111 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHAF1AQ13111 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHAF1AQ13111 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHAF1AQ13111 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHAF1AQ13111 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHAF1AQ13111 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHAF1AQ13111 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CHAF1AQ13111 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CHAF1AQ13111 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHAF1AQ13111 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHAF1AQ13111 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CHAF1AQ13111 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHAF1AQ13111 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHAF1AQ13111 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHAF1AQ13111 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHAF1AQ13111 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHAF1AQ13111 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHAF1AQ13111 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHAF1AQ13111 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHAF1AQ13111 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
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