Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPQ12770 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPQ12770 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPQ12770 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPQ12770 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPQ12770 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPQ12770 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPQ12770 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAPQ12770 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPQ12770 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPQ12770 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAPQ12770 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPQ12770 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPQ12770 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCAPQ12770 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCAPQ12770 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPQ12770 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPQ12770 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPQ12770 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPQ12770 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPQ12770 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SCAPQ12770 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPQ12770 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPQ12770 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPQ12770 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPQ12770 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPQ12770 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPQ12770 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPQ12770 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPQ12770 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPQ12770 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPQ12770 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SCAPQ12770 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAPQ12770 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAPQ12770 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms