Protein–RNA interactions for Protein: Q06190

PPP2R3A, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R3AQ06190 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PPP2R3AQ06190 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP2R3AQ06190 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP2R3AQ06190 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP2R3AQ06190 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP2R3AQ06190 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP2R3AQ06190 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP2R3AQ06190 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP2R3AQ06190 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP2R3AQ06190 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP2R3AQ06190 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP2R3AQ06190 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP2R3AQ06190 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP2R3AQ06190 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP2R3AQ06190 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP2R3AQ06190 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP2R3AQ06190 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP2R3AQ06190 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP2R3AQ06190 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP2R3AQ06190 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP2R3AQ06190 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP2R3AQ06190 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP2R3AQ06190 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPP2R3AQ06190 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPP2R3AQ06190 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPP2R3AQ06190 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms