Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL18AQ02543 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL18AQ02543 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL18AQ02543 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL18AQ02543 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms