Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITPNAQ00169 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNAQ00169 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITPNAQ00169 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITPNAQ00169 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITPNAQ00169 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms