Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBX1P83916 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBX1P83916 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBX1P83916 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBX1P83916 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBX1P83916 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBX1P83916 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBX1P83916 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX1P83916 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX1P83916 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBX1P83916 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBX1P83916 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBX1P83916 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBX1P83916 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CBX1P83916 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CBX1P83916 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX1P83916 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CBX1P83916 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CBX1P83916 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBX1P83916 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBX1P83916 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBX1P83916 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBX1P83916 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBX1P83916 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CBX1P83916 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBX1P83916 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBX1P83916 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBX1P83916 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX1P83916 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX1P83916 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX1P83916 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX1P83916 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX1P83916 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX1P83916 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX1P83916 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX1P83916 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX1P83916 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX1P83916 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX1P83916 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX1P83916 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX1P83916 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX1P83916 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX1P83916 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBX1P83916 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBX1P83916 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBX1P83916 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CBX1P83916 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CBX1P83916 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CBX1P83916 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX1P83916 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX1P83916 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX1P83916 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX1P83916 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX1P83916 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX1P83916 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX1P83916 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CBX1P83916 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CBX1P83916 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX1P83916 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX1P83916 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CBX1P83916 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX1P83916 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX1P83916 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX1P83916 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX1P83916 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX1P83916 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBX1P83916 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBX1P83916 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBX1P83916 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX1P83916 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX1P83916 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX1P83916 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CBX1P83916 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CBX1P83916 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CBX1P83916 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBX1P83916 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBX1P83916 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CBX1P83916 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBX1P83916 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBX1P83916 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBX1P83916 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBX1P83916 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBX1P83916 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBX1P83916 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBX1P83916 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX1P83916 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX1P83916 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBX1P83916 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CBX1P83916 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CBX1P83916 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBX1P83916 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBX1P83916 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX1P83916 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX1P83916 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX1P83916 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CBX1P83916 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CBX1P83916 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX1P83916 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX1P83916 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX1P83916 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms