Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
IRX6P78412 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
IRX6P78412 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
IRX6P78412 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IRX6P78412 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IRX6P78412 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IRX6P78412 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
IRX6P78412 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
IRX6P78412 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IRX6P78412 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IRX6P78412 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IRX6P78412 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IRX6P78412 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
IRX6P78412 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
IRX6P78412 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
IRX6P78412 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
IRX6P78412 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
IRX6P78412 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
IRX6P78412 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
IRX6P78412 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
IRX6P78412 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
IRX6P78412 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
IRX6P78412 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
IRX6P78412 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
IRX6P78412 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
IRX6P78412 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
IRX6P78412 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
IRX6P78412 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
IRX6P78412 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
IRX6P78412 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
IRX6P78412 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
IRX6P78412 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
IRX6P78412 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
IRX6P78412 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
IRX6P78412 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
IRX6P78412 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
IRX6P78412 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
IRX6P78412 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
IRX6P78412 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
IRX6P78412 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
IRX6P78412 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
IRX6P78412 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
IRX6P78412 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IRX6P78412 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IRX6P78412 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IRX6P78412 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IRX6P78412 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IRX6P78412 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IRX6P78412 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
IRX6P78412 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IRX6P78412 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IRX6P78412 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
IRX6P78412 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IRX6P78412 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IRX6P78412 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
IRX6P78412 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IRX6P78412 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
IRX6P78412 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
IRX6P78412 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
IRX6P78412 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
IRX6P78412 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
IRX6P78412 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IRX6P78412 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
IRX6P78412 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
IRX6P78412 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
IRX6P78412 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
IRX6P78412 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
IRX6P78412 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
IRX6P78412 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
IRX6P78412 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
IRX6P78412 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
IRX6P78412 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
IRX6P78412 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
IRX6P78412 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
IRX6P78412 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
IRX6P78412 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
IRX6P78412 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
IRX6P78412 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
IRX6P78412 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IRX6P78412 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IRX6P78412 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
IRX6P78412 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
IRX6P78412 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
IRX6P78412 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
IRX6P78412 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
IRX6P78412 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
IRX6P78412 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
IRX6P78412 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
IRX6P78412 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
IRX6P78412 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IRX6P78412 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IRX6P78412 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
IRX6P78412 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IRX6P78412 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IRX6P78412 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IRX6P78412 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
IRX6P78412 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IRX6P78412 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IRX6P78412 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IRX6P78412 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms