Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HERVK_113P62684 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HERVK_113P62684 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HERVK_113P62684 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HERVK_113P62684 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HERVK_113P62684 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HERVK_113P62684 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HERVK_113P62684 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HERVK_113P62684 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HERVK_113P62684 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
HERVK_113P62684 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HERVK_113P62684 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
HERVK_113P62684 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HERVK_113P62684 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HERVK_113P62684 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HERVK_113P62684 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HERVK_113P62684 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HERVK_113P62684 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HERVK_113P62684 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HERVK_113P62684 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HERVK_113P62684 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HERVK_113P62684 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HERVK_113P62684 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms