Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEFSECP57772 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEFSECP57772 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEFSECP57772 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEFSECP57772 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEFSECP57772 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEFSECP57772 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEFSECP57772 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEFSECP57772 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEFSECP57772 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEFSECP57772 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEFSECP57772 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEFSECP57772 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EEFSECP57772 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEFSECP57772 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms