Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPD52P55327 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPD52P55327 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPD52P55327 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPD52P55327 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPD52P55327 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPD52P55327 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPD52P55327 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPD52P55327 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPD52P55327 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPD52P55327 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPD52P55327 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TPD52P55327 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPD52P55327 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPD52P55327 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPD52P55327 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPD52P55327 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPD52P55327 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPD52P55327 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPD52P55327 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPD52P55327 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPD52P55327 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPD52P55327 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPD52P55327 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPD52P55327 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPD52P55327 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPD52P55327 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPD52P55327 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPD52P55327 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPD52P55327 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPD52P55327 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPD52P55327 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPD52P55327 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPD52P55327 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPD52P55327 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPD52P55327 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPD52P55327 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPD52P55327 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPD52P55327 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPD52P55327 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPD52P55327 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPD52P55327 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPD52P55327 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPD52P55327 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPD52P55327 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TPD52P55327 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPD52P55327 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPD52P55327 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPD52P55327 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPD52P55327 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPD52P55327 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPD52P55327 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPD52P55327 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPD52P55327 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPD52P55327 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPD52P55327 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPD52P55327 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPD52P55327 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPD52P55327 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPD52P55327 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPD52P55327 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPD52P55327 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPD52P55327 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPD52P55327 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPD52P55327 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPD52P55327 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPD52P55327 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPD52P55327 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52P55327 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52P55327 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52P55327 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52P55327 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52P55327 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52P55327 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPD52P55327 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPD52P55327 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TPD52P55327 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TPD52P55327 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPD52P55327 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPD52P55327 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPD52P55327 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPD52P55327 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPD52P55327 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPD52P55327 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPD52P55327 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPD52P55327 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPD52P55327 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPD52P55327 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPD52P55327 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPD52P55327 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPD52P55327 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPD52P55327 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPD52P55327 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPD52P55327 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPD52P55327 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPD52P55327 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPD52P55327 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPD52P55327 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPD52P55327 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPD52P55327 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms