Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
BRPF1P55201 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
BRPF1P55201 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRPF1P55201 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRPF1P55201 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BRPF1P55201 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
BRPF1P55201 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRPF1P55201 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRPF1P55201 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BRPF1P55201 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRPF1P55201 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRPF1P55201 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BRPF1P55201 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRPF1P55201 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BRPF1P55201 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRPF1P55201 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRPF1P55201 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRPF1P55201 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
BRPF1P55201 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRPF1P55201 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRPF1P55201 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRPF1P55201 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
BRPF1P55201 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRPF1P55201 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRPF1P55201 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
BRPF1P55201 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
BRPF1P55201 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BRPF1P55201 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.8■■■■□ 3
BRPF1P55201 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BRPF1P55201 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BRPF1P55201 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
BRPF1P55201 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BRPF1P55201 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BRPF1P55201 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRPF1P55201 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRPF1P55201 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRPF1P55201 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRPF1P55201 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms