Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLNS1AP54105 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLNS1AP54105 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLNS1AP54105 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLNS1AP54105 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLNS1AP54105 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLNS1AP54105 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLNS1AP54105 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLNS1AP54105 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLNS1AP54105 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLNS1AP54105 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLNS1AP54105 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLNS1AP54105 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLNS1AP54105 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLNS1AP54105 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms