Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBP50607 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBP50607 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBP50607 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBP50607 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBP50607 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBP50607 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBP50607 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBP50607 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBP50607 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBP50607 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBP50607 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBP50607 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBP50607 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBP50607 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBP50607 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBP50607 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBP50607 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBP50607 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBP50607 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBP50607 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBP50607 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBP50607 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBP50607 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBP50607 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBP50607 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBP50607 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBP50607 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBP50607 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBP50607 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBP50607 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBP50607 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBP50607 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBP50607 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBP50607 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBP50607 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBP50607 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBP50607 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBP50607 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBP50607 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBP50607 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBP50607 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBP50607 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBP50607 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBP50607 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBP50607 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBP50607 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBP50607 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBP50607 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBP50607 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBP50607 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBP50607 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBP50607 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBP50607 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBP50607 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBP50607 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBP50607 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBP50607 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBP50607 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBP50607 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBP50607 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBP50607 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBP50607 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBP50607 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBP50607 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBP50607 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBP50607 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBP50607 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBP50607 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBP50607 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBP50607 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBP50607 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBP50607 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBP50607 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBP50607 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBP50607 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBP50607 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBP50607 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBP50607 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBP50607 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBP50607 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBP50607 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBP50607 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBP50607 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBP50607 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBP50607 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBP50607 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBP50607 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBP50607 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBP50607 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBP50607 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBP50607 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBP50607 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBP50607 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBP50607 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBP50607 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBP50607 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBP50607 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBP50607 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBP50607 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms