Protein–RNA interactions for Protein: P49750

YLPM1, YLP motif-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YLPM1P49750 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YLPM1P49750 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YLPM1P49750 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YLPM1P49750 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YLPM1P49750 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YLPM1P49750 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms