Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POU3F4P49335 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POU3F4P49335 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POU3F4P49335 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POU3F4P49335 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POU3F4P49335 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POU3F4P49335 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms