Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMUP48645 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMUP48645 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMUP48645 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMUP48645 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMUP48645 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMUP48645 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMUP48645 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMUP48645 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMUP48645 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMUP48645 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMUP48645 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMUP48645 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMUP48645 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMUP48645 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NMUP48645 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMUP48645 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMUP48645 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMUP48645 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMUP48645 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMUP48645 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMUP48645 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NMUP48645 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMUP48645 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMUP48645 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMUP48645 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMUP48645 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMUP48645 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMUP48645 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMUP48645 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMUP48645 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMUP48645 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMUP48645 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMUP48645 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMUP48645 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMUP48645 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMUP48645 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMUP48645 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMUP48645 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMUP48645 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMUP48645 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMUP48645 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMUP48645 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMUP48645 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMUP48645 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMUP48645 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMUP48645 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMUP48645 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMUP48645 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMUP48645 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMUP48645 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMUP48645 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMUP48645 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMUP48645 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMUP48645 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMUP48645 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMUP48645 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMUP48645 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMUP48645 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMUP48645 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMUP48645 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMUP48645 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMUP48645 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMUP48645 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMUP48645 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMUP48645 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMUP48645 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMUP48645 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMUP48645 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMUP48645 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMUP48645 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMUP48645 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMUP48645 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMUP48645 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMUP48645 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMUP48645 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMUP48645 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMUP48645 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMUP48645 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NMUP48645 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMUP48645 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMUP48645 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NMUP48645 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NMUP48645 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NMUP48645 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NMUP48645 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NMUP48645 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NMUP48645 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NMUP48645 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NMUP48645 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NMUP48645 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMUP48645 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMUP48645 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NMUP48645 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NMUP48645 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMUP48645 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMUP48645 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMUP48645 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMUP48645 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMUP48645 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms