Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP13P45452 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP13P45452 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP13P45452 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP13P45452 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP13P45452 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP13P45452 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP13P45452 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP13P45452 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP13P45452 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP13P45452 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP13P45452 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP13P45452 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP13P45452 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP13P45452 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP13P45452 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP13P45452 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP13P45452 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP13P45452 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP13P45452 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP13P45452 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP13P45452 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MMP13P45452 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMP13P45452 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP13P45452 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP13P45452 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP13P45452 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP13P45452 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MMP13P45452 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP13P45452 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP13P45452 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP13P45452 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP13P45452 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP13P45452 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP13P45452 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP13P45452 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP13P45452 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP13P45452 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP13P45452 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP13P45452 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP13P45452 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP13P45452 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP13P45452 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP13P45452 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP13P45452 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP13P45452 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP13P45452 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP13P45452 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP13P45452 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP13P45452 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP13P45452 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP13P45452 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP13P45452 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP13P45452 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP13P45452 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP13P45452 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP13P45452 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP13P45452 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP13P45452 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP13P45452 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP13P45452 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP13P45452 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP13P45452 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP13P45452 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP13P45452 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP13P45452 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP13P45452 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP13P45452 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP13P45452 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP13P45452 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP13P45452 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP13P45452 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP13P45452 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP13P45452 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP13P45452 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP13P45452 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP13P45452 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP13P45452 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP13P45452 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP13P45452 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP13P45452 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP13P45452 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP13P45452 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP13P45452 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP13P45452 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP13P45452 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP13P45452 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP13P45452 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP13P45452 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP13P45452 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP13P45452 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP13P45452 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP13P45452 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP13P45452 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP13P45452 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP13P45452 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP13P45452 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP13P45452 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP13P45452 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP13P45452 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms