Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTSKP43235 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSKP43235 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSKP43235 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSKP43235 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSKP43235 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSKP43235 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTSKP43235 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSKP43235 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSKP43235 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTSKP43235 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTSKP43235 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSKP43235 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSKP43235 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSKP43235 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSKP43235 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSKP43235 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSKP43235 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTSKP43235 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTSKP43235 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTSKP43235 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTSKP43235 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTSKP43235 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTSKP43235 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTSKP43235 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CTSKP43235 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTSKP43235 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTSKP43235 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTSKP43235 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTSKP43235 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTSKP43235 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTSKP43235 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTSKP43235 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTSKP43235 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTSKP43235 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTSKP43235 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTSKP43235 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTSKP43235 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTSKP43235 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTSKP43235 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTSKP43235 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTSKP43235 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTSKP43235 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTSKP43235 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTSKP43235 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTSKP43235 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTSKP43235 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTSKP43235 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTSKP43235 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTSKP43235 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTSKP43235 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTSKP43235 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTSKP43235 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTSKP43235 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTSKP43235 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTSKP43235 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTSKP43235 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTSKP43235 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTSKP43235 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTSKP43235 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTSKP43235 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTSKP43235 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTSKP43235 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTSKP43235 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTSKP43235 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTSKP43235 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTSKP43235 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTSKP43235 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTSKP43235 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTSKP43235 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTSKP43235 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTSKP43235 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTSKP43235 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CTSKP43235 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CTSKP43235 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTSKP43235 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTSKP43235 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTSKP43235 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTSKP43235 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTSKP43235 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTSKP43235 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTSKP43235 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTSKP43235 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CTSKP43235 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CTSKP43235 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CTSKP43235 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTSKP43235 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTSKP43235 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTSKP43235 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTSKP43235 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTSKP43235 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTSKP43235 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTSKP43235 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTSKP43235 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTSKP43235 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTSKP43235 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTSKP43235 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CTSKP43235 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTSKP43235 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTSKP43235 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms