Protein–RNA interactions for Protein: P41235

HNF4A, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4AP41235 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HNF4AP41235 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HNF4AP41235 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNF4AP41235 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNF4AP41235 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HNF4AP41235 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HNF4AP41235 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms