Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGCXP38435 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGCXP38435 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGCXP38435 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGCXP38435 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGCXP38435 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGCXP38435 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGCXP38435 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGCXP38435 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGCXP38435 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGCXP38435 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGCXP38435 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGCXP38435 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGCXP38435 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGCXP38435 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGCXP38435 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GGCXP38435 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGCXP38435 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGCXP38435 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGCXP38435 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGCXP38435 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGCXP38435 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGCXP38435 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGCXP38435 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GGCXP38435 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGCXP38435 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGCXP38435 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGCXP38435 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGCXP38435 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GGCXP38435 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGCXP38435 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GGCXP38435 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GGCXP38435 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GGCXP38435 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GGCXP38435 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GGCXP38435 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GGCXP38435 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GGCXP38435 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGCXP38435 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGCXP38435 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGCXP38435 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGCXP38435 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGCXP38435 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGCXP38435 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGCXP38435 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGCXP38435 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGCXP38435 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGCXP38435 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGCXP38435 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GGCXP38435 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGCXP38435 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGCXP38435 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGCXP38435 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGCXP38435 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGCXP38435 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGCXP38435 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGCXP38435 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGCXP38435 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGCXP38435 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGCXP38435 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGCXP38435 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGCXP38435 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGCXP38435 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGCXP38435 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGCXP38435 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGCXP38435 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGCXP38435 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGCXP38435 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGCXP38435 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGCXP38435 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGCXP38435 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGCXP38435 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGCXP38435 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGCXP38435 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGCXP38435 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGCXP38435 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGCXP38435 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGCXP38435 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GGCXP38435 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGCXP38435 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGCXP38435 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGCXP38435 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGCXP38435 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGCXP38435 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGCXP38435 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GGCXP38435 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GGCXP38435 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GGCXP38435 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GGCXP38435 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGCXP38435 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGCXP38435 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGCXP38435 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGCXP38435 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGCXP38435 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGCXP38435 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGCXP38435 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GGCXP38435 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GGCXP38435 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGCXP38435 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGCXP38435 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms