Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCNN1AP37088 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCNN1AP37088 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCNN1AP37088 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCNN1AP37088 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCNN1AP37088 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCNN1AP37088 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCNN1AP37088 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCNN1AP37088 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCNN1AP37088 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCNN1AP37088 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCNN1AP37088 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCNN1AP37088 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCNN1AP37088 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCNN1AP37088 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCNN1AP37088 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCNN1AP37088 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCNN1AP37088 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCNN1AP37088 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCNN1AP37088 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCNN1AP37088 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCNN1AP37088 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCNN1AP37088 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCNN1AP37088 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms