Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2IP36954 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2IP36954 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2IP36954 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2IP36954 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2IP36954 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2IP36954 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2IP36954 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2IP36954 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2IP36954 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2IP36954 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2IP36954 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2IP36954 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2IP36954 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2IP36954 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms