Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THBS4P35443 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS4P35443 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS4P35443 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS4P35443 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS4P35443 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS4P35443 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS4P35443 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS4P35443 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS4P35443 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS4P35443 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS4P35443 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS4P35443 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS4P35443 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS4P35443 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS4P35443 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS4P35443 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS4P35443 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS4P35443 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS4P35443 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS4P35443 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS4P35443 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS4P35443 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS4P35443 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS4P35443 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS4P35443 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS4P35443 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS4P35443 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS4P35443 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS4P35443 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS4P35443 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS4P35443 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS4P35443 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS4P35443 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS4P35443 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS4P35443 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS4P35443 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS4P35443 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS4P35443 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS4P35443 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS4P35443 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS4P35443 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS4P35443 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS4P35443 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS4P35443 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS4P35443 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS4P35443 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS4P35443 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THBS4P35443 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
THBS4P35443 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THBS4P35443 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
THBS4P35443 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THBS4P35443 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THBS4P35443 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THBS4P35443 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THBS4P35443 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THBS4P35443 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THBS4P35443 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THBS4P35443 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
THBS4P35443 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THBS4P35443 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
THBS4P35443 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THBS4P35443 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THBS4P35443 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
THBS4P35443 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS4P35443 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS4P35443 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS4P35443 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS4P35443 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS4P35443 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS4P35443 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS4P35443 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS4P35443 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THBS4P35443 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THBS4P35443 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THBS4P35443 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS4P35443 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS4P35443 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS4P35443 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS4P35443 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THBS4P35443 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THBS4P35443 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
THBS4P35443 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THBS4P35443 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THBS4P35443 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS4P35443 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS4P35443 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS4P35443 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS4P35443 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS4P35443 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS4P35443 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS4P35443 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THBS4P35443 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THBS4P35443 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THBS4P35443 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THBS4P35443 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THBS4P35443 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THBS4P35443 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THBS4P35443 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THBS4P35443 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms