Protein–RNA interactions for Protein: P30050

RPL12, 60S ribosomal protein L12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL12P30050 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL12P30050 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL12P30050 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL12P30050 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL12P30050 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL12P30050 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL12P30050 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL12P30050 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL12P30050 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL12P30050 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL12P30050 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL12P30050 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL12P30050 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL12P30050 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL12P30050 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL12P30050 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL12P30050 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL12P30050 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL12P30050 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL12P30050 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL12P30050 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL12P30050 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL12P30050 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL12P30050 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL12P30050 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL12P30050 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL12P30050 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL12P30050 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL12P30050 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL12P30050 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL12P30050 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL12P30050 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL12P30050 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL12P30050 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL12P30050 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL12P30050 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL12P30050 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL12P30050 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL12P30050 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL12P30050 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL12P30050 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL12P30050 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL12P30050 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL12P30050 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL12P30050 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL12P30050 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL12P30050 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL12P30050 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL12P30050 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL12P30050 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL12P30050 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL12P30050 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL12P30050 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL12P30050 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL12P30050 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL12P30050 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL12P30050 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL12P30050 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL12P30050 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL12P30050 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL12P30050 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL12P30050 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL12P30050 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL12P30050 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL12P30050 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL12P30050 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL12P30050 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL12P30050 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL12P30050 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL12P30050 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL12P30050 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL12P30050 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL12P30050 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL12P30050 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL12P30050 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL12P30050 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL12P30050 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL12P30050 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL12P30050 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL12P30050 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL12P30050 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL12P30050 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL12P30050 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL12P30050 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL12P30050 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL12P30050 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL12P30050 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL12P30050 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL12P30050 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL12P30050 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL12P30050 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL12P30050 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL12P30050 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL12P30050 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL12P30050 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL12P30050 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL12P30050 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL12P30050 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL12P30050 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL12P30050 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms