Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POU1F1P28069 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POU1F1P28069 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POU1F1P28069 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POU1F1P28069 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POU1F1P28069 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POU1F1P28069 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POU1F1P28069 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POU1F1P28069 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POU1F1P28069 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POU1F1P28069 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POU1F1P28069 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms