Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DMAP28067 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DMAP28067 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DMAP28067 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DMAP28067 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DMAP28067 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DMAP28067 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DMAP28067 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DMAP28067 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DMAP28067 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DMAP28067 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DMAP28067 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DMAP28067 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DMAP28067 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DMAP28067 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DMAP28067 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DMAP28067 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms