Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMB9P28065 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB9P28065 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB9P28065 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSMB9P28065 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB9P28065 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms