Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM3P25205 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM3P25205 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM3P25205 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM3P25205 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM3P25205 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MCM3P25205 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM3P25205 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM3P25205 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MCM3P25205 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MCM3P25205 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCM3P25205 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM3P25205 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM3P25205 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM3P25205 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCM3P25205 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCM3P25205 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM3P25205 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM3P25205 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCM3P25205 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCM3P25205 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCM3P25205 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM3P25205 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM3P25205 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM3P25205 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM3P25205 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM3P25205 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM3P25205 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM3P25205 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM3P25205 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM3P25205 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MCM3P25205 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM3P25205 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM3P25205 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM3P25205 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM3P25205 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM3P25205 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM3P25205 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM3P25205 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM3P25205 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM3P25205 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3P25205 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3P25205 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3P25205 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3P25205 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3P25205 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM3P25205 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM3P25205 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM3P25205 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM3P25205 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM3P25205 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM3P25205 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM3P25205 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM3P25205 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM3P25205 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM3P25205 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM3P25205 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM3P25205 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM3P25205 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM3P25205 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM3P25205 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM3P25205 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM3P25205 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM3P25205 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM3P25205 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM3P25205 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM3P25205 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM3P25205 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM3P25205 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM3P25205 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MCM3P25205 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM3P25205 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM3P25205 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM3P25205 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCM3P25205 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM3P25205 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM3P25205 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM3P25205 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM3P25205 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM3P25205 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM3P25205 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM3P25205 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM3P25205 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM3P25205 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM3P25205 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM3P25205 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM3P25205 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM3P25205 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM3P25205 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM3P25205 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM3P25205 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM3P25205 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM3P25205 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM3P25205 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM3P25205 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCM3P25205 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCM3P25205 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCM3P25205 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3P25205 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM3P25205 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms