Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCHP24723 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCHP24723 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCHP24723 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCHP24723 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCHP24723 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCHP24723 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCHP24723 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCHP24723 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCHP24723 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRKCHP24723 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCHP24723 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCHP24723 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRKCHP24723 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKCHP24723 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKCHP24723 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRKCHP24723 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCHP24723 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCHP24723 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCHP24723 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKCHP24723 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKCHP24723 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKCHP24723 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCHP24723 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCHP24723 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCHP24723 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCHP24723 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCHP24723 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms