Protein–RNA interactions for Protein: P23415

GLRA1, Glycine receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLRA1P23415 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLRA1P23415 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLRA1P23415 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLRA1P23415 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLRA1P23415 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLRA1P23415 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms