Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3AP20336 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3AP20336 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3AP20336 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3AP20336 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3AP20336 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3AP20336 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3AP20336 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms