Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDCP19113 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDCP19113 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDCP19113 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDCP19113 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDCP19113 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDCP19113 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDCP19113 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDCP19113 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDCP19113 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDCP19113 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDCP19113 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDCP19113 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDCP19113 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDCP19113 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDCP19113 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDCP19113 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDCP19113 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDCP19113 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDCP19113 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDCP19113 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDCP19113 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDCP19113 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDCP19113 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDCP19113 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDCP19113 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDCP19113 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDCP19113 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDCP19113 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDCP19113 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDCP19113 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDCP19113 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDCP19113 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDCP19113 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDCP19113 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HDCP19113 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HDCP19113 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDCP19113 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDCP19113 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDCP19113 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HDCP19113 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDCP19113 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDCP19113 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDCP19113 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDCP19113 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDCP19113 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDCP19113 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDCP19113 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDCP19113 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDCP19113 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HDCP19113 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDCP19113 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDCP19113 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDCP19113 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDCP19113 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDCP19113 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDCP19113 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDCP19113 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDCP19113 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HDCP19113 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDCP19113 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDCP19113 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDCP19113 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDCP19113 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDCP19113 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDCP19113 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDCP19113 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDCP19113 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDCP19113 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDCP19113 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDCP19113 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDCP19113 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HDCP19113 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDCP19113 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDCP19113 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDCP19113 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDCP19113 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDCP19113 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDCP19113 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDCP19113 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDCP19113 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDCP19113 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDCP19113 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDCP19113 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDCP19113 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDCP19113 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDCP19113 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDCP19113 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDCP19113 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDCP19113 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDCP19113 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDCP19113 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDCP19113 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDCP19113 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDCP19113 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDCP19113 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDCP19113 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDCP19113 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDCP19113 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDCP19113 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms