Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT15P19012 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT15P19012 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT15P19012 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT15P19012 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT15P19012 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT15P19012 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT15P19012 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT15P19012 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT15P19012 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT15P19012 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT15P19012 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT15P19012 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT15P19012 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT15P19012 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT15P19012 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT15P19012 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT15P19012 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT15P19012 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT15P19012 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT15P19012 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT15P19012 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT15P19012 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT15P19012 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT15P19012 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT15P19012 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT15P19012 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT15P19012 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT15P19012 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT15P19012 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT15P19012 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT15P19012 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT15P19012 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT15P19012 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT15P19012 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT15P19012 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT15P19012 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT15P19012 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT15P19012 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT15P19012 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT15P19012 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT15P19012 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT15P19012 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT15P19012 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT15P19012 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT15P19012 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT15P19012 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT15P19012 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT15P19012 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT15P19012 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT15P19012 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT15P19012 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT15P19012 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT15P19012 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT15P19012 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT15P19012 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT15P19012 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT15P19012 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT15P19012 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT15P19012 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT15P19012 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT15P19012 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT15P19012 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT15P19012 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT15P19012 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT15P19012 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT15P19012 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT15P19012 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT15P19012 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT15P19012 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT15P19012 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT15P19012 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT15P19012 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT15P19012 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT15P19012 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT15P19012 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT15P19012 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT15P19012 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT15P19012 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT15P19012 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT15P19012 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT15P19012 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT15P19012 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT15P19012 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT15P19012 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT15P19012 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT15P19012 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT15P19012 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT15P19012 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT15P19012 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT15P19012 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT15P19012 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT15P19012 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT15P19012 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms