Protein–RNA interactions for Protein: P16581

SELE, E-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELEP16581 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SELEP16581 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SELEP16581 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SELEP16581 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SELEP16581 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SELEP16581 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SELEP16581 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SELEP16581 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SELEP16581 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SELEP16581 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SELEP16581 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SELEP16581 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SELEP16581 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SELEP16581 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SELEP16581 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SELEP16581 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SELEP16581 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SELEP16581 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SELEP16581 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SELEP16581 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SELEP16581 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SELEP16581 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SELEP16581 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SELEP16581 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELEP16581 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELEP16581 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELEP16581 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SELEP16581 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SELEP16581 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SELEP16581 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELEP16581 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELEP16581 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELEP16581 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELEP16581 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELEP16581 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELEP16581 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELEP16581 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELEP16581 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELEP16581 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELEP16581 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELEP16581 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SELEP16581 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SELEP16581 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELEP16581 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELEP16581 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELEP16581 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELEP16581 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELEP16581 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELEP16581 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELEP16581 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELEP16581 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELEP16581 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELEP16581 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELEP16581 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELEP16581 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELEP16581 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELEP16581 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SELEP16581 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELEP16581 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELEP16581 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELEP16581 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELEP16581 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELEP16581 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELEP16581 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELEP16581 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SELEP16581 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELEP16581 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELEP16581 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELEP16581 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELEP16581 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELEP16581 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELEP16581 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELEP16581 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELEP16581 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SELEP16581 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELEP16581 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELEP16581 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELEP16581 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELEP16581 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELEP16581 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELEP16581 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELEP16581 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELEP16581 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SELEP16581 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELEP16581 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELEP16581 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SELEP16581 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELEP16581 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELEP16581 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELEP16581 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELEP16581 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELEP16581 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SELEP16581 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELEP16581 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SELEP16581 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELEP16581 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELEP16581 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELEP16581 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELEP16581 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELEP16581 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms