Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACADSP16219 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACADSP16219 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACADSP16219 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACADSP16219 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACADSP16219 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACADSP16219 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADSP16219 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADSP16219 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSP16219 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSP16219 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSP16219 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSP16219 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACADSP16219 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACADSP16219 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACADSP16219 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADSP16219 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADSP16219 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACADSP16219 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACADSP16219 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACADSP16219 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACADSP16219 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ACADSP16219 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACADSP16219 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACADSP16219 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACADSP16219 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACADSP16219 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACADSP16219 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACADSP16219 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACADSP16219 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACADSP16219 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACADSP16219 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADSP16219 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADSP16219 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADSP16219 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADSP16219 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACADSP16219 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADSP16219 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADSP16219 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADSP16219 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADSP16219 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADSP16219 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADSP16219 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADSP16219 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACADSP16219 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACADSP16219 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSP16219 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSP16219 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSP16219 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADSP16219 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADSP16219 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADSP16219 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADSP16219 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADSP16219 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADSP16219 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADSP16219 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSP16219 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSP16219 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSP16219 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSP16219 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSP16219 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSP16219 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADSP16219 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACADSP16219 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACADSP16219 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACADSP16219 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACADSP16219 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACADSP16219 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACADSP16219 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACADSP16219 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACADSP16219 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACADSP16219 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACADSP16219 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACADSP16219 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACADSP16219 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACADSP16219 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACADSP16219 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACADSP16219 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACADSP16219 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACADSP16219 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACADSP16219 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACADSP16219 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACADSP16219 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACADSP16219 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACADSP16219 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACADSP16219 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACADSP16219 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACADSP16219 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACADSP16219 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACADSP16219 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACADSP16219 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACADSP16219 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACADSP16219 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACADSP16219 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACADSP16219 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADSP16219 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADSP16219 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADSP16219 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADSP16219 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADSP16219 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms