Protein–RNA interactions for Protein: P15622

ZNF250, Zinc finger protein 250, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF250P15622 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF250P15622 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF250P15622 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF250P15622 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF250P15622 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF250P15622 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF250P15622 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms