Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYL4P12829 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYL4P12829 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYL4P12829 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYL4P12829 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYL4P12829 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYL4P12829 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYL4P12829 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYL4P12829 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYL4P12829 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYL4P12829 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL4P12829 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL4P12829 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL4P12829 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL4P12829 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL4P12829 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MYL4P12829 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYL4P12829 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYL4P12829 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYL4P12829 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYL4P12829 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYL4P12829 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYL4P12829 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYL4P12829 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYL4P12829 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYL4P12829 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL4P12829 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL4P12829 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL4P12829 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL4P12829 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYL4P12829 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYL4P12829 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYL4P12829 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYL4P12829 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYL4P12829 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYL4P12829 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYL4P12829 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYL4P12829 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYL4P12829 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYL4P12829 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYL4P12829 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYL4P12829 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
MYL4P12829 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYL4P12829 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYL4P12829 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MYL4P12829 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYL4P12829 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYL4P12829 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYL4P12829 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYL4P12829 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYL4P12829 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYL4P12829 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYL4P12829 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYL4P12829 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYL4P12829 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYL4P12829 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYL4P12829 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYL4P12829 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYL4P12829 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYL4P12829 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MYL4P12829 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MYL4P12829 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYL4P12829 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYL4P12829 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYL4P12829 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYL4P12829 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYL4P12829 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYL4P12829 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYL4P12829 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYL4P12829 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYL4P12829 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYL4P12829 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYL4P12829 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYL4P12829 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYL4P12829 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYL4P12829 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYL4P12829 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYL4P12829 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYL4P12829 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYL4P12829 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYL4P12829 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYL4P12829 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYL4P12829 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYL4P12829 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYL4P12829 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYL4P12829 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MYL4P12829 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYL4P12829 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYL4P12829 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYL4P12829 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYL4P12829 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYL4P12829 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYL4P12829 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYL4P12829 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYL4P12829 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYL4P12829 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYL4P12829 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYL4P12829 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYL4P12829 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYL4P12829 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms