Protein–RNA interactions for Protein: P11801

PSKH1, Serine/threonine-protein kinase H1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSKH1P11801 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSKH1P11801 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PSKH1P11801 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSKH1P11801 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSKH1P11801 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSKH1P11801 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSKH1P11801 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms