Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CD63P08962 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD63P08962 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD63P08962 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD63P08962 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD63P08962 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD63P08962 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD63P08962 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD63P08962 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD63P08962 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD63P08962 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD63P08962 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD63P08962 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD63P08962 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD63P08962 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD63P08962 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD63P08962 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD63P08962 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CD63P08962 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD63P08962 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD63P08962 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD63P08962 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD63P08962 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD63P08962 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD63P08962 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD63P08962 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD63P08962 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD63P08962 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD63P08962 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD63P08962 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD63P08962 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD63P08962 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD63P08962 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD63P08962 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD63P08962 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD63P08962 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CD63P08962 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD63P08962 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD63P08962 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD63P08962 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD63P08962 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD63P08962 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD63P08962 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD63P08962 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD63P08962 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD63P08962 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD63P08962 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD63P08962 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD63P08962 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CD63P08962 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD63P08962 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD63P08962 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD63P08962 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CD63P08962 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD63P08962 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD63P08962 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD63P08962 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD63P08962 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD63P08962 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD63P08962 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD63P08962 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD63P08962 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD63P08962 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD63P08962 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD63P08962 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD63P08962 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD63P08962 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD63P08962 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD63P08962 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD63P08962 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD63P08962 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD63P08962 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD63P08962 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD63P08962 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD63P08962 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD63P08962 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD63P08962 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD63P08962 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD63P08962 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD63P08962 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD63P08962 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD63P08962 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD63P08962 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD63P08962 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD63P08962 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD63P08962 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CD63P08962 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD63P08962 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD63P08962 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD63P08962 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD63P08962 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD63P08962 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD63P08962 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD63P08962 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD63P08962 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD63P08962 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD63P08962 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD63P08962 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD63P08962 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD63P08962 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms