Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TPM2P07951 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TPM2P07951 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TPM2P07951 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TPM2P07951 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TPM2P07951 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TPM2P07951 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TPM2P07951 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TPM2P07951 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TPM2P07951 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TPM2P07951 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TPM2P07951 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TPM2P07951 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TPM2P07951 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TPM2P07951 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TPM2P07951 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TPM2P07951 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TPM2P07951 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TPM2P07951 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TPM2P07951 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TPM2P07951 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TPM2P07951 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TPM2P07951 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TPM2P07951 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TPM2P07951 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TPM2P07951 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TPM2P07951 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TPM2P07951 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TPM2P07951 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TPM2P07951 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TPM2P07951 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TPM2P07951 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TPM2P07951 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TPM2P07951 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TPM2P07951 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TPM2P07951 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TPM2P07951 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TPM2P07951 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TPM2P07951 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TPM2P07951 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TPM2P07951 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TPM2P07951 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TPM2P07951 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TPM2P07951 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TPM2P07951 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TPM2P07951 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TPM2P07951 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TPM2P07951 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TPM2P07951 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TPM2P07951 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TPM2P07951 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TPM2P07951 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TPM2P07951 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TPM2P07951 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TPM2P07951 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TPM2P07951 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TPM2P07951 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TPM2P07951 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TPM2P07951 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TPM2P07951 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TPM2P07951 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TPM2P07951 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TPM2P07951 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TPM2P07951 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TPM2P07951 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TPM2P07951 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TPM2P07951 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TPM2P07951 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TPM2P07951 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPM2P07951 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TPM2P07951 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPM2P07951 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPM2P07951 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TPM2P07951 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TPM2P07951 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TPM2P07951 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TPM2P07951 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TPM2P07951 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TPM2P07951 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TPM2P07951 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TPM2P07951 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TPM2P07951 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TPM2P07951 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM2P07951 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM2P07951 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM2P07951 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM2P07951 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM2P07951 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPM2P07951 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPM2P07951 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPM2P07951 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPM2P07951 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPM2P07951 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPM2P07951 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPM2P07951 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TPM2P07951 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TPM2P07951 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPM2P07951 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPM2P07951 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPM2P07951 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms