Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SERPIND1P05546 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPIND1P05546 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPIND1P05546 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPIND1P05546 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPIND1P05546 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPIND1P05546 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPIND1P05546 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1460.2 ms