Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGHA1P01876 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGHA1P01876 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGHA1P01876 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGHA1P01876 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGHA1P01876 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGHA1P01876 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHA1P01876 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHA1P01876 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHA1P01876 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGHA1P01876 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHA1P01876 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHA1P01876 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHA1P01876 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHA1P01876 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHA1P01876 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms