Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRUB2O95900 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRUB2O95900 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRUB2O95900 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRUB2O95900 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRUB2O95900 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms